Pain
Naruto y los demás van venciando a los Akatsuki. Los Akatsuki no obstante, se cargan a Sarutobi, el maestro ese que siempre va con el cigarro. Primero parece que el jefazo de ellos es Pain. Aparecen distintos tipos que son Pain también (son en realidad un grupito de estética similar). Este grupito se carga a Jiraya, el tío este que estaba enseñando a Naruto desde pequeño. Naruto encuentra unas escrituras de Jiraya y se pone a entrenar para conseguir un nuevo power-up que no sé cómo se llama pero yo lo llamo modo rana. El grupito de los Pain mientras tanto van a la aldea de la Hoja a liarla no recuerdo por qué, y después de estar luchando un rato caen todos los Pain excepto uno que es como el principal, el cual mete un bombazo enorme que se carga casi toda la aldea. Queda poca resistencia pero entonces llega Naruto con su modo rana para salvar el día. Después de luchar un rato, Naruto queda apresado por Pain, a lo que viene Hinata a protegerlo, escena que sirve para que esta se confiese por fin a Naruto. A Pain se la suda totalmente el asunto y se medio carga a Hinata, haciendo que Naruto entre en modo berserk-kyubi-tevasacagarentodo y protagonice la lucha contra Pain que tanto se comentó en el anime por su peculiar animación. Si no me equivoco Naruto vence al final. Peeeeero parece que todos estos Pains en realidad eran gente ya muerta controlados por otro tío llamado Nagato, que se escondía en un bosque. Naruto va a su búsqueda, lo encuentra, y en lugar d eluchar contra él, lo persuade para que deje de hacer el mal. Nagato se vuelve bueno y da su vida haciendo un último jutsu que revive a la gente que murió en el ataque ese tan bestia en la aldea de la hoja. Uno de los jefazos terminado, pero creo que Nagato ya le avisa de que ahora el malo maloso es otro, el tío enmascarado de los Akatsuki.
Paralelamente a todo esto, que me lo salté casi todo, Sasuke se carga a su hermano Itachi. Sasuke descubre que Itachi no era malo en realidad, era bueno y quería proteger la aldea de la hoja.
La guerra
Naruto se pira a entrenar para controlar a Kurama, el zorro ese que lleva dentro. Para ello va a encontrarse con otro tío que tiene otra de las bestias estas (hay varias, desde la de una cola hasta la de nueve): Bee, que es un tío que va de molón rapeando mientras habla. Aquí no recuerdo mucho. Naruto en su entrenamiento interno, deshace un jutsu que tenía dentro suyo, que permite ver a su padre y a su madre al fin. Que por cierto, su padre se descubre que fue Hokage. Sus padres le cuentan el por qué de sellarle el zorro dentro y tal, (el padre tiene la mitad del poder del zorro sellado dentro suyo y la otra mitad está en Naruto), se disculpan por haberle dejado solo, ya que murieron cuando el zorro invadió la aldea de la hoja en el pasado, y al fin se despiden de su hijo. Después de otra vez una larga charla, Naruto consigue hacerse amiguito de Kurama. Esto le permite tomar prestado el chakra de Kurama, consiguiendo u nuevo powerup que es el modo Super Sonic kyubi. Pero claro, los malos no descansan. Ahora el malo maloso, el enmascarado ese, organiza con otro de los akatsuki un ejército enorme de clones de este tipo. Este enorme ejército obliga a que las varias villas que hay, la de la hoja la de la arena y tal, formen un ejército conjunto. Empieza la gran guerra shinobi, que sirve para ver a los distintos ninjas de la hoja lucirse. Pero cuando empeizan a ir ganando los buenos, aparece un nuevo fistro para liarla: Kabuto, el tío con gafas que iba con Orochimaru. Kabuto se une al tío enmascarado, (el cual se cambia de máscara para la ocasión) ofreciéndole una habilidad suya, la de revivir a ninjas ya difuntos y usarlos a su merced para luchar contra el ejército bueno. De este modo, los malos resucitan a un montonazo de personajes, tanto buenos como malos, que a pesar de que pueden pensar por sí mismos, sus cuerpos trabajan a las órdenes de los malos. Los muertos revividos estos se caracterizan por tener los ojos negros. Esta resurreción masiva permite el retorno de personajes muertos de anteriores sagas, dando lugar a escenas de reconciliación con antepasados o miembros queridos, o enfrentamientos con amigos ya difuntos. Esta parte se hace bastante larga con unas cuantas batallas más para que se luzcan los ninjas amigos de Naruto. Naruto aparece con su nuevo modo Kyubi para ayudar a sus amigos, quedando más o menos el tío enmascarado solo contra los buenos. La lucha se alarga. De entre los revividos, aparece Madara Uchiha. El tío es jodidamente poderoso y sobrado, y ni los líderes más fuertes de las villas unidos logran vencerle.
Paralelamente, Itachi es revivido con el jutsu este de antes, pero creo que desde el principio es capaz de moverse libremente, así que intenta detener el jutsu que controla a los muertos revividos. Itachi se reencuentra con Sasuke y juntos va a parar la fuente del jutsu. Ambos se encuentran con Kabuto y logran vencerle y deshacer el justu de los zombis. La lucha hace que los hermanos hagan las paces, y como se anula el jutsu de resurrección, Itachi desaparece también definitivamente, diciéndole a Sasuke que le quiere.
Obito
Los zombis desaparecen pero el cabronazo de Madara ni se inmuta no recuerdo por qué. Si no recuerdo mal, mientras los líderes eran apalizados por Madara, Naruto y los otros luchan contra el tío enmascarado. Al final logran desenmascararlo, y resulta ser Obito Uchiha, el cual cuando era niño formaba un trío con Kakashi y otra chica que le gustaba a Obito, en plan el trío que eran Sasuke Naruto y Sakura. Obito se hizo malo porque vio cómo Kakashi mató a la chica esta que le gustaba (no recuerdo por qué la mató, pero era en plan que era porque no tenían más remedio), y entonces un ya viejo Madara "adoptó" a Obito y lo entrenó, haciendo que preparase todo lo que ha sucedido hasta ahora. Vamos, se descubre que Madara es el malo maloso que organizó todo todo todo. Naruto y los otros luchan contra Obito. En el proceso Obito invoca a la última de las bestias estas de las colas, a la de diez colas, que es más fea que el pegar a una madre. Se tiran un buen rato peleando contra el bicho, y no recuerdo cómo Obito termina absorbiendo al bicho y toma una nueva forma de semidios.
Mientras, Sasuke se reencuentra entre otros con Orochimaru. Juntitos van a la aldea de la Hoja, porque Sasuke busca respuestas, porque antes quería destruir la aldea pero después de todo lo de su hermano está confuso. Van al templo de los Uchiha, y ahí Sasuke creo que pidiéndoselo a Orochimaru, revive a los antiguos Hokages. Sasuke pregunta a Hashirama, el primero de los hokages, qué es ser un ninja, y Hashirama le explica en un flashback el origen de la aldea de la hoja y su relación con Madara, ya que la aldea la fundaron los dos. Después del flashback, Sasuke decide que quiere proteger la aldea, así que va a unirse a la batalla de Naruto. Los hokages revividos se unen.
Sasuke y los hokages se unen a la batalla junto a Naruto contra Obito y Madara. Esto permite escenas bastante majas como a Naruto y a su padre Minato luchar juntos, o Naruto, Sasuke y Sakura reunirse como equipo. Como Madara es la rehostia de fuerte, Hashirama, su rival del pasado y también la rehostia de fuerte, decide luchar contra él, así que el resto se queda contra Obito. La pelea dura un buen rato, hasta que Naruto logra comerle el coco con sus conversaciones sentimentaloides: Obito en sus orígenes era como Naruto, un marginadillo que quería ser Hokage y demostrar a todos que es el mejor y priteger su aldea. Obito se emosiona y se hace de los buenos.
Madara
Al sobrado de Madara se la suda la caída de Obito y sigue con la suya. Por lo visto, su plan es activar un jutsu que consiste en hacer aparecer un árbol que captura a todas las personas, chupa su chakra, y lo concentra en un fruto, el cual se quiere comer para así conseguir todo el chakra. Según nos cuentan, en el inicio de los tiempos, los humanos no tenían chakra, y fue con la llegada de una diosa, llamada Kaguya que pudieron obtenerlo. En principio el chakra iba a ser para poder aturar todas las guerras delos humanos, pero estos lo usaron como arma. Madara quiere terminar con esto comiendo el fruto ese.
Madara vence a Hashirama y haciéndole nosequé (pilla poder suyo), consigue dejar de ser un muerto viviente y ser un ser vivo normal y mortal. Todos los buenos, Obito incluido, se ponen a luchar contra Madara. Después de una larga batalla, Madara absorbe a todas las bestias de colas y pasa a un modo de semidios similar al que tenía antes Obito. Naruto y Sasuke terminan hechos polvo luchando contra él. Mientras se recuperan, el resto intenta luchar contra Madara. Descubren que los jutsus especiales que usan chakra no sirven porque el Uchiha lo absorbe, así que entra en escena Gai, que usa ataques simplemente físicos, y protagoniza algunas escenas bastante molonas, ya que abre las ocho puertas internas de su cuerpo (cosa que multiplica el poder por 100 pero asegura tu muerte) y le arrea una somanta de hostias que dejan a Madara fino, aunque consigue aguantar. Madara es invencible ahora mismo.
Mientras tanto, Naruto y Sasuke, hechos polvo y desmayados, son "visitados espiritualmente" por Hagoromo, un dios que es hijo de la diosa Kaguya. Hagoromo les explica a Sasuke y a Naruto que él es el que en realidad trajo el chakra y el ninjutsu a los humanos, con fines pacíficos, pero que terminó siendo usado como arma. Les cuenta también que él tuvo dos hijos, a los que transmitió su poder repartido, y estos dos hijos estuvieron enfrentados. A lo largo de la historia esos dos hijos enfrentados se habían reencarnado en otras personas, como Hashirama y Madara, y ahora en la actualidad, en Naruto y Sasuke. Después de toda la charla, Hagoromo, contrario a las intenciones de Madara, pasa a Naruto y Sasuke su poder. Los dos reviven super dopados de poder para cargarse a madara. Por ejemplo, Gai, que está a punto de morir por haber abierto las ocho puertas, es "curado" por Naruto con un sólo toque de mano.
Madara activa la técnica del árbol ese e inmobiliza prácticamente a todo dios excepto a Naruto, Sasuke, Sakura, Kakashi, Obito y pocos más que los hokages. Pero Naruto lanza un ataque contra el árbol y lo corta. No obstante, mientras el árbol cae, Madara oye una voz diciéndole que absorba el árbol que cae. Lo hace y Madara se transforma en Kaguya.
Kaguya
Kaguya la lía parda con sus poderes enormes capaces de crear y moverse por dimensiones de hielo, de fuego, etc. Resumiendo bastante, los buenos logran vencer a Kaguya gracias a los nuevos poderes de Sasuke y Naruto, y gracias a la ayuda de Obito, que muere gastando todo su chakra para ayudar a los buenos a moverse por esas dimensiones para encontrar a Kaguya. Kaguya es vencida gracias a un ataque conjunto de Naruto, Sasuke y Sakura.
Llegados a este punto, Kaguya desaparece quedando el cuerpo de Madara derrotado en el suelo. Escena con los buenos, los hokages y las bestias con colas que habían sido absorbidas. Los hokages desaparecen, no sin antes despedirse Minato de su hijo Naruto. Todo ha terminado, sólo queda liberar a la gente del árbol ese.
Sasuke
"Que te lo crees tú, morena de la copla" dijo Sasuke, que en un revés del destino se le cruzan los cables, y con su nuevo poder, sella a las bestias y decide que él será el nuevo mandatario del mundo para asegurar que no hay más dolor en el mundo, pero que para ello, necesita terminar con lo último que le queda en el mundo: Naruto. Después de que Sasuke hace callar a Sakura que intenta hacer razonar al loco este, ambos se van al sitio ese de las estatuas donde lucharon cuando eran pequeños. Ahí mantienen una lucha cortita, donde después de un ataque muy fuerte terminan los dos tirados en el suelo sin un brazo. Se quedan un buen rato hablando, y Sasuke reconoce la derrota, Sakura los encuentra y cura a ambos. Sasuke se diculpa a Naruto y Sakura por todo. Todos vuelven a ser amiguitos.
Naruto y Sasuke usan su poder conjunto para liberar a la gente atrapada en el árbol ese. Poquito tiempo después, Kakashi es nombrado nuevo Hokage de la villa de la Hoja. Naruto recupera el brazo gracias a la ayuda de Tsunade. Sasuke se libra de ser apresado por favor de Naruto y se pira de viaje espiritual.
Esto es el final del capítulo 699. Ya luego viene el 700 que es donde vemos a todo dios mayorcito con hijos y tal, que ya dejo que te lo leas tú. xD